Paletten dienen zum Organisieren von Werkzeugsammlungen (z. B. Voreinstellungen für Formen- und Mal-Werkzeuge, Falloff, Stempel, Schablonen, Material und Beleuchtung). Elemente können im Fenstermenü der Palette () hinzugefügt, entfernt, neu angeordnet oder umbenannt werden. Elemente in einer Palette lassen sich durch Ziehen mit der mittleren Maustaste neu anordnen.
Mithilfe der Nummerntasten auf der Tastatur können Sie Elemente in Mudbox-Paletten schnell wählen. Durch Drücken der Tasten 1 bis 9 wird die entsprechende Werkzeugposition in der aktiven Werkzeugpalette gewählt. Ziehen Sie bei gedrückter mittlerer Maustaste die am häufigsten verwendeten Werkzeuge an die ersten neun Positionen in einer Palette.
Paletten sind in den folgenden Verzeichnissen als Textdateien gespeichert, die manuell mit einem Texteditor bearbeitet werden können:
Jede Zeile der Textdatei ist anhand folgender Konvention organisiert: Objekt/Werkzeug;Name;Symbol;Beschriftung.